Kyōto Animation là một trong những xưởng phim anime được tán dương nhất tại Nhật Bản, được biết đến với các tác phẩm như Suzumiya Haruhi, K-On! và Clannad.[2] Công ty có một số văn phòng khác nhau trong thành phố. Xưởng phim 1 được đặt tại Fushimi. Xưởng phim 2 (Trụ sở chính của KyoAni), xưởng phim 5, và bộ phận phát triển hàng hóa được đặt tại Uji, cách xưởng phim 1 một ga tàu. Tòa nhà được dùng chủ yếu bởi nhân viên chỉ đạo hoạt hình và được xây dựng vào năm 2007.[3][4][5]

Một vài tuần trước cuộc tấn công, Kyōto Animation nhận được rất nhiều thư đe dọa được gửi đến công ty. Chủ tịch của công ty, Hatta Hideaki, cho biết rằng không biết những bức thư này có liên quan đến vụ phóng hỏa hay không, vì chúng được gửi nặc danh.[6] Dù vậy, ông vẫn trình báo với cảnh sát và luật sư về vụ việc. Sau khi cảnh sát Nhật Bản nhận được tin báo về những mối đe dọa vào tháng 10 năm 2018, họ tạm đi tuần tra quanh trụ sở chính ở thời điểm đó.[7]